Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scd3Q99PL7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms