Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GpnmbQ99P91 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms