Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ms4a4dQ99N05 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a4dQ99N05 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms