Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkd1Q99MH6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkd1Q99MH6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkd1Q99MH6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkd1Q99MH6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkd1Q99MH6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkd1Q99MH6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkd1Q99MH6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkd1Q99MH6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkd1Q99MH6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkd1Q99MH6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkd1Q99MH6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkd1Q99MH6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkd1Q99MH6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkd1Q99MH6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkd1Q99MH6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkd1Q99MH6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkd1Q99MH6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkd1Q99MH6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkd1Q99MH6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkd1Q99MH6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkd1Q99MH6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkd1Q99MH6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkd1Q99MH6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms