Protein–RNA interactions for Protein: Q99M03

Rwdd2b, RWD domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd2bQ99M03 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rwdd2bQ99M03 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rwdd2bQ99M03 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rwdd2bQ99M03 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rwdd2bQ99M03 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms