Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms