Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gdpd3Q99LY2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdpd3Q99LY2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms