Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnpo2Q99LG2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnpo2Q99LG2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnpo2Q99LG2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnpo2Q99LG2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnpo2Q99LG2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnpo2Q99LG2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnpo2Q99LG2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnpo2Q99LG2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnpo2Q99LG2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnpo2Q99LG2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnpo2Q99LG2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnpo2Q99LG2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnpo2Q99LG2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnpo2Q99LG2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnpo2Q99LG2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnpo2Q99LG2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms