Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms