Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms