Protein–RNA interactions for Protein: Q99L28

Rsl24d1, Probable ribosome biogenesis protein RLP24, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsl24d1Q99L28 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsl24d1Q99L28 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsl24d1Q99L28 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsl24d1Q99L28 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsl24d1Q99L28 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsl24d1Q99L28 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsl24d1Q99L28 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsl24d1Q99L28 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsl24d1Q99L28 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsl24d1Q99L28 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsl24d1Q99L28 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsl24d1Q99L28 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsl24d1Q99L28 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsl24d1Q99L28 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsl24d1Q99L28 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms