Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TriobpQ99KW3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms