Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nlgn1Q99K10 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlgn1Q99K10 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms