Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms