Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd1Q99J36 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd1Q99J36 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd1Q99J36 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd1Q99J36 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd1Q99J36 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd1Q99J36 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd1Q99J36 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd1Q99J36 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd1Q99J36 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd1Q99J36 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd1Q99J36 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd1Q99J36 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd1Q99J36 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd1Q99J36 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thumpd1Q99J36 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms