Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Rnf144aQ925F3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Rnf144aQ925F3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rnf144aQ925F3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rnf144aQ925F3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rnf144aQ925F3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rnf144aQ925F3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rnf144aQ925F3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rnf144aQ925F3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Rnf144aQ925F3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Rnf144aQ925F3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf144aQ925F3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
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