Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Lmo1Q924W9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Lmo1Q924W9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Lmo1Q924W9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Lmo1Q924W9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lmo1Q924W9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmo1Q924W9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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