Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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