Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Smarca5Q91ZW3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smarca5Q91ZW3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms