Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc5a4bQ91ZP4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc5a4bQ91ZP4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc5a4bQ91ZP4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc5a4bQ91ZP4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc5a4bQ91ZP4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4bQ91ZP4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms