Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD4

Vangl2, Vang-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vangl2Q91ZD4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vangl2Q91ZD4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vangl2Q91ZD4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vangl2Q91ZD4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vangl2Q91ZD4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vangl2Q91ZD4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vangl2Q91ZD4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vangl2Q91ZD4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vangl2Q91ZD4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vangl2Q91ZD4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vangl2Q91ZD4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vangl2Q91ZD4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vangl2Q91ZD4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vangl2Q91ZD4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vangl2Q91ZD4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vangl2Q91ZD4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vangl2Q91ZD4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vangl2Q91ZD4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vangl2Q91ZD4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vangl2Q91ZD4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vangl2Q91ZD4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vangl2Q91ZD4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vangl2Q91ZD4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vangl2Q91ZD4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms