Protein–RNA interactions for Protein: Q91YL3

Uckl1, Uridine-cytidine kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uckl1Q91YL3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Uckl1Q91YL3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uckl1Q91YL3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms