Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Synpo2Q91YE8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Synpo2Q91YE8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms