Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY7

Pcdhga12, Protocadherin gamma A12, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga12Q91XY7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcdhga12Q91XY7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms