Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Basp1Q91XV3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms