Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lims2Q91XD2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lims2Q91XD2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lims2Q91XD2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lims2Q91XD2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lims2Q91XD2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lims2Q91XD2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lims2Q91XD2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lims2Q91XD2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lims2Q91XD2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lims2Q91XD2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lims2Q91XD2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lims2Q91XD2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lims2Q91XD2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lims2Q91XD2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lims2Q91XD2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lims2Q91XD2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lims2Q91XD2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lims2Q91XD2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lims2Q91XD2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lims2Q91XD2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lims2Q91XD2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lims2Q91XD2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lims2Q91XD2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lims2Q91XD2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lims2Q91XD2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lims2Q91XD2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lims2Q91XD2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms