Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna2Q91X60 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna2Q91X60 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna2Q91X60 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna2Q91X60 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna2Q91X60 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna2Q91X60 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna2Q91X60 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna2Q91X60 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna2Q91X60 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna2Q91X60 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna2Q91X60 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna2Q91X60 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna2Q91X60 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna2Q91X60 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna2Q91X60 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna2Q91X60 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna2Q91X60 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna2Q91X60 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna2Q91X60 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna2Q91X60 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna2Q91X60 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna2Q91X60 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna2Q91X60 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Mterf1a-201ENSMUST00000044746 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna2Q91X60 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms