Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC3

Acsl6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl6Q91WC3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acsl6Q91WC3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Acsl6Q91WC3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms