Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Klc3Q91W40 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms