Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp3Q91W36 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms