Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cabp4Q8VHC5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cabp4Q8VHC5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cabp4Q8VHC5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cabp4Q8VHC5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cabp4Q8VHC5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cabp4Q8VHC5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cabp4Q8VHC5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cabp4Q8VHC5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cabp4Q8VHC5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cabp4Q8VHC5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cabp4Q8VHC5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cabp4Q8VHC5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cabp4Q8VHC5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cabp4Q8VHC5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cabp4Q8VHC5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cabp4Q8VHC5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cabp4Q8VHC5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cabp4Q8VHC5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cabp4Q8VHC5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cabp4Q8VHC5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cabp4Q8VHC5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cabp4Q8VHC5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cabp4Q8VHC5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cabp4Q8VHC5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cabp4Q8VHC5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms