Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms