Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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