Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE65

Taf12, Transcription initiation factor TFIID subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf12Q8VE65 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf12Q8VE65 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms