Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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