Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCK3

Tubg2, Tubulin gamma-2 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg2Q8VCK3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg2Q8VCK3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms