Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Ubxn4Q8VCH8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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