Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ApobrQ8VBT6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ApobrQ8VBT6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms