Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2N2

Utp4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp4Q8R2N2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp4Q8R2N2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Utp4Q8R2N2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms