Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Rnf183Q8QZS5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Rnf183Q8QZS5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Rnf183Q8QZS5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Rnf183Q8QZS5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Rnf183Q8QZS5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms