Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Hoxc12Q8K5B8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Hoxc12Q8K5B8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hoxc12Q8K5B8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hoxc12Q8K5B8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hoxc12Q8K5B8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hoxc12Q8K5B8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc12Q8K5B8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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