Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf39Q8K2Z2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms