Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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FgbQ8K0E8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FgbQ8K0E8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FgbQ8K0E8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FgbQ8K0E8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FgbQ8K0E8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FgbQ8K0E8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FgbQ8K0E8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FgbQ8K0E8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FgbQ8K0E8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FgbQ8K0E8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FgbQ8K0E8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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