Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZP2

Syn3, Synapsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syn3Q8JZP2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syn3Q8JZP2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syn3Q8JZP2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms