Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE96

Trmt6, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase non-catalytic subunit TRM6, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt6Q8CE96 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Trmt6Q8CE96 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trmt6Q8CE96 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trmt6Q8CE96 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trmt6Q8CE96 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trmt6Q8CE96 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trmt6Q8CE96 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt6Q8CE96 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt6Q8CE96 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt6Q8CE96 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt6Q8CE96 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt6Q8CE96 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt6Q8CE96 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt6Q8CE96 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt6Q8CE96 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt6Q8CE96 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trmt6Q8CE96 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt6Q8CE96 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt6Q8CE96 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt6Q8CE96 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt6Q8CE96 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trmt6Q8CE96 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt6Q8CE96 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt6Q8CE96 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt6Q8CE96 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt6Q8CE96 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt6Q8CE96 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trmt6Q8CE96 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt6Q8CE96 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt6Q8CE96 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trmt6Q8CE96 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trmt6Q8CE96 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt6Q8CE96 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trmt6Q8CE96 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trmt6Q8CE96 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trmt6Q8CE96 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt6Q8CE96 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt6Q8CE96 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt6Q8CE96 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt6Q8CE96 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Trmt6Q8CE96 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt6Q8CE96 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt6Q8CE96 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt6Q8CE96 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt6Q8CE96 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt6Q8CE96 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt6Q8CE96 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt6Q8CE96 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt6Q8CE96 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt6Q8CE96 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt6Q8CE96 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt6Q8CE96 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt6Q8CE96 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt6Q8CE96 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt6Q8CE96 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt6Q8CE96 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt6Q8CE96 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt6Q8CE96 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt6Q8CE96 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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