Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pramef8Q8CE24 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Pramef8Q8CE24 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Pramef8Q8CE24 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Pramef8Q8CE24 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Pramef8Q8CE24 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramef8Q8CE24 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Pramef8Q8CE24 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121 ms