Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lancl3Q8CD19 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lancl3Q8CD19 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms