Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms