Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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