Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
E4f1Q8CCE9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E4f1Q8CCE9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E4f1Q8CCE9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E4f1Q8CCE9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E4f1Q8CCE9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E4f1Q8CCE9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E4f1Q8CCE9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E4f1Q8CCE9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms